Claude Science : le workbench IA d'Anthropic

Claude Science est une application de bureau lancée par Anthropic le 30 juin 2026 qui réunit Claude, l’exécution de code en local, des artefacts scientifiques reproductibles, plus de 60 connecteurs de bases de données et un agent reviewer dans un seul environnement de recherche. Elle s’adresse aux chercheurs en biologie computationnelle et joue, pour la science, le rôle que Claude Code joue pour le développement logiciel.

L’idée centrale est simple : arrêter de jongler entre bases de données, formats de fichiers, notebooks, terminaux et systèmes de calcul. Anthropic décrit Claude Science comme un environnement où « les scientifiques peuvent mener toutes les étapes de leur travail » sans quitter l’application. Disponible en bêta, elle fonctionne sur macOS et Linux, en local ou sur une machine distante via SSH.

J’ai passé au crible l’annonce, la documentation officielle et les premiers retours de laboratoires pour ce guide. Mon objectif : vous dire ce que l’outil fait réellement, sur quels plans il tourne et à qui il s’adresse, sans reprendre le discours marketing.

Qu’est-ce que Claude Science, concrètement

Claude Science est un poste de travail agentique pour la recherche. Au lieu d’un chat qui produit du texte, vous disposez d’un agent qui planifie une analyse, écrit du code, l’exécute sur vos données, génère des figures et vérifie son propre travail avant de vous le présenter.

L’application vise en priorité la biologie computationnelle : génomique, single-cell RNA-seq, protéomique, biologie structurale et chéminformatique. Ce ciblage explique la présence de connecteurs spécialisés et du rendu natif de structures moléculaires, absents d’un outil généraliste.

La distinction avec Claude Code est utile pour se repérer. Les deux partagent le même socle — un agent qui exécute du code en local — mais Claude Code s’adresse aux développeurs dans un terminal, tandis que Claude Science ajoute les briques propres au travail scientifique.

Claude Science reunit cinq briques autour d’un meme agent : rendu natif, 60+ connecteurs, calcul HPC, revue automatique et provenance des artefacts.

Les fonctionnalités clés

Rendu natif des artefacts scientifiques

Claude Science affiche directement les objets de la recherche en sciences du vivant. Il rend nativement les structures 3D de protéines, les pistes de génome (genome tracks), les structures chimiques et d’autres artefacts riches, sans passer par un outil externe.

Vous pouvez demander des ajustements en langage naturel — par exemple retirer les lignes de grille d’un graphique ou changer une palette. L’application intègre aussi les modèles BioNeMo de NVIDIA, dont Evo 2, Boltz-2 et OpenFold3, pour la prédiction de structures.

Plus de 60 connecteurs et skills

L’application donne accès à plus de 60 skills et connecteurs scientifiques préconfigurés. Ils couvrent les grandes bases de référence du domaine : UniProt, PDB, Ensembl, Reactome, ClinVar, ChEMBL ou GEO, entre autres.

Cette logique de skills réutilisables rejoint celle des connecteurs de Claude, mais orientée recherche. Un laboratoire peut aussi construire ses propres skills : l’Allen Institute a bâti un système de revue computationnelle multi-agents reposant sur 20 skills sur mesure.

Orchestration HPC/Slurm et calcul Modal

Claude Science gère le calcul du portable jusqu’à des centaines de GPU. Les jobs s’exécutent sur des kernels locaux, sur votre cluster Slurm via SSH (soumission par sbatch), ou via votre compte Modal pour du GPU à la demande.

Le point important pour la confidentialité : les données volumineuses ou sensibles restent sur votre infrastructure. L’application soumet un plan, demande votre accord avant de mobiliser une nouvelle ressource, et vous laisse examiner ou révoquer chaque décision avant l’envoi d’un job. Les chemins des gros fichiers restés sur l’hôte sont enregistrés dans la session.

L’agent reviewer, garde-fou de la traçabilité

L’agent reviewer est la fonctionnalité qui distingue le plus Claude Science d’un notebook classique. Il tourne en parallèle et compare les affirmations de Claude à ses réponses récentes, au plan approuvé, aux artefacts et à l’historique d’exécution.

Il signale les affirmations non étayées, les problèmes de citation, les étapes manquantes et les figures ou chiffres qui ne collent pas aux données. Sa limite est claire et assumée : il ne relance pas les analyses et ne décide pas si la méthode était la bonne. Il contrôle la traçabilité, pas la validité scientifique. Cette philosophie de vérification parallèle rappelle celle des agents managés de Claude.

Reproductibilité de premier plan

Chaque artefact produit — figure, tableau, notebook, manuscrit — peut embarquer sa provenance. Lorsque Claude Science crée une figure, il sauvegarde le code exact et l’environnement qui l’ont générée, une note en langage clair sur sa construction, et l’historique complet des messages.

Concrètement, un pair peut ouvrir la figure et remonter jusqu’au code source. Vous pouvez aussi forker une session pour comparer plusieurs approches analytiques en parallèle, ce qui facilite les tests de robustesse.

De la verification des prerequis a la premiere analyse : le parcours d’installation de Claude Science en 5 etapes.

Comment installer et démarrer Claude Science

L’installation se fait depuis claude.com/science, avec un compte Claude sur un plan éligible. Voici les étapes principales.

1. Vérifiez les prérequis système. macOS 13 minimum ou Linux x64 (Windows n’est pas pris en charge au lancement). Prévoyez environ 5 Go d’espace disque pour le runtime et les environnements de départ.
2. Sous Linux, installez les dépendances. L’application requiert socat, bubblewrap 0.8.0 ou plus récent, et l’activation des espaces de noms utilisateur non privilégiés.
3. Téléchargez et lancez l’application depuis claude.com/science, puis connectez-vous avec votre compte Claude.
4. Connectez vos ressources. Ajoutez vos bases de données via les connecteurs, et configurez l’accès SSH à vos machines distantes (workstation, nœud HPC) ou votre compte Modal si vous prévoyez du calcul lourd.
5. Lancez une première analyse. Décrivez votre objectif en langage naturel ; Claude Science propose un plan, exécute le code après validation, et l’agent reviewer contrôle le résultat.

Les environnements par défaut incluent NumPy, pandas, SciPy, matplotlib, seaborn et Pillow côté Python, ainsi que tidyverse, ggplot2 et jsonlite côté R. De quoi démarrer une analyse sans configuration lourde.

Plans éligibles et tarifs

Claude Science est disponible en bêta sur quatre plans : Pro, Max, Team et Enterprise. Sur Team et Enterprise, un administrateur doit activer la fonctionnalité avant que les membres puissent l’utiliser. L’usage est décompté sur les limites de votre plan, partagées avec Claude Code et Cowork.

Les laboratoires académiques et les organisations à but non lucratif peuvent obtenir un tarif Team réduit, vérifié via un chercheur principal. Si vous hésitez sur le plan à prendre, notre guide des abonnements Claude détaille les limites d’usage de chacun.

Au lancement, Anthropic a aussi ouvert un programme « AI for Science » : jusqu’à 50 projets soutenus à hauteur de 30 000 $ de crédits chacun, avec un complément Modal pouvant atteindre 2 000 $ par projet.

Cas d’usage et premiers retours

Claude Science excelle sur les workflows où l’analyse de code, la donnée et la littérature se croisent. Les usages mis en avant couvrent l’annotation single-cell RNA-seq, les pipelines génomiques, l’analyse de structures protéiques, la chéminformatique, les revues de littérature avec vérification des citations et l’itération de figures publiables.

Trois retours d’expérience illustrent les gains rapportés au lancement :

• Allen Institute — Jérôme Lecoq a monté un système de revue computationnelle multi-agents avec 20 skills sur mesure. Là où rédiger une telle revue pouvait prendre jusqu’à deux ans, son équipe a produit une dizaine de revues, souvent de plus de 100 pages, avec des citations contrôlées par les agents reviewers.
• UCSF Brain Tumor Center — selon Stephen Francis, l’analyse de bilans germinaux a été menée « en environ un dixième du temps » nécessaire auparavant.
• Manifold Bio — l’entreprise a utilisé Claude Science pour identifier des candidats-médicaments ciblant certains tissus, en évaluant expression de surface, trafic cellulaire et sécurité sur ses données propriétaires.

Ces chiffres viennent d’Anthropic et de partenaires : ils décrivent des cas réels, pas des garanties de résultat. Comme pour tout agent, la valeur dépend de la qualité du cadrage et de la relecture humaine.

Faut-il adopter Claude Science

Notre avis : Claude Science est pertinent si votre travail combine régulièrement code, grosses données biologiques et exigence de traçabilité. Le trio rendu natif des molécules, orchestration HPC et agent reviewer répond à des frictions réelles du quotidien de recherche.

Trois réserves méritent d’être posées. L’outil est en bêta, donc appelé à évoluer. Il ne couvre pas Windows au lancement, ce qui exclut une partie des postes de laboratoire. Enfin, l’agent reviewer contrôle la traçabilité, pas la justesse scientifique : la relecture experte reste indispensable.

Pour les équipes déjà à l’aise avec l’écosystème agentique d’Anthropic, la marche est faible. Si vous utilisez Claude Code au quotidien, vous retrouverez immédiatement les réflexes de planification, d’exécution et de vérification, transposés au terrain scientifique.

Mon verdict : je recommande de tester Claude Science si vous travaillez sur des données biologiques volumineuses et que la traçabilité conditionne la publication de vos résultats. Pour un usage ponctuel ou hors sciences du vivant, j’attendrais la sortie de bêta et le support Windows avant de migrer mes workflows.